본 발명은 LGI3의 발현 내지 활성 수준을 이용하는, 동맥경화 중증도 진단용 마커 조성물, 동맥경화 중증도 진단용 조성물, 상기 조성물을 포함하는 동맥경화 중증도 진단용 키트, 동맥경화 예방 또는 치료용 물질을 스크리닝하는 방법 및 동맥경화 중증도 진단에 대한 정보를 제공하는 방법에 관한 것으로, 본 발명에 따르면 동맥경화 중증도를 진단 또는 예측할 수 있고, 이러한 정보를 통해 맞춤의학 및 예측의학 실현이 가능하다. 나아가 본 발명은 LGI3 길항제를 투여하여 다른 신진대사 표현형에 영향을 미치지 않고, 동맥경화를 치료할 수 있다.