본 발명은 흑미 추출물 또는 흑미 용매 분획물을 유효성분으로 포함하는 헬리코박터 파이로리(Helicobater pylori) 감염 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물 및 흑미 용매 분획물을 제조하느 방법에 관한 것이다.특히 흑미 추출물 또는 흑미유래 시아니딘 3-O-글루코사이드 흑미 분획물의 유효성분은 헬리코박터 파이로리의 생육 억제활성, 헬리코박터 파일로리 유레이즈 억제활성 및 CagA, VacA, SecA의 독소 분비억제 활성을 나타내며, 흑미 유래의 안전한 천연소재 이므로 인체에 안전성, 저독성 및 항생제 남용에 의한 내성균 발생을 억제하는 안전한 헬리코박터 파이로리 예방 또는 치료용 약학적 조성물, 건강식품, 음료 및 첨가물로 유용하게 이용 될 수 있다.