본 발명은 컴퓨터로 구현되는 슬래브 최적구조 설계시스템에 의해 수행되는 이방향 슬래브의 바닥진동필터링(FVF)을 포함하는 슬래브 최적구조 설계방법에 있어서, 설계변수 설정부에서 대상부재의 설계변수를 설정하는 S100 단계; 소요하중 산출부에서 건물용도에 따른 소요하중을 산출하는 S200 단계; 유전자 알고리즘부에서 환경성, 경제성 및 사용성을 동시에 고려하면서, 최적해 탐색을 위해 유전자 알고리즘을 구동시키는 S300 단계; 및 필터링부에서 상기 S300 단계에서 구해진 다수의 해를 허용가속도 기준치 설정을 통해 필터링하는 S400 단계를 포함하는 이방향 슬래브의 바닥진동필터링(FVF)을 포함하는 슬래브 최적구조 설계방법이다.