기준점 결정 방법을 제공한다. 본 발명의 실시예에 따른 기준점 결정 방법은 (a) 기준점 결정 모듈(210)이 두부 3차원 의료 영상에 대해 미리 설정된 방법에 따라 코뿌리점(Nasion), 대후두공(Foramen magnum)의 중점, 안형요와(Sellar), 한 쌍의 포리온(Porion) 및 한 쌍의 안과점(Orbitale)을 포함하는 기준점 중 하나 이상의 기준점을 결정하는 단계 및 (b) 기준 평면 결정 모듈(220)이 상기 기준점 결정 모듈(210)에 의해 결정된 기준점이 포함되는 정중시상면(Mid Sagittal Plane, MSP) 및 프랑크프루트면(Frankfurt Plane, FHP)을 포함하는 기준 평면 중 하나 이상의 기준 평면을 결정하는 단계를 포함할 수 있다.