본 발명은 연료전지의 시스템효율을 향상시키기 위한 연료전지 핫박스 관한 것으로, 하우징 내부에 연료전지 스택부, 후연소기, 개질기 및 공기-열교환부 및 연료-열교환부를 모두 구비하고 있어, 연료전지 스택부의 열과 후연소기에서 발생하는 연소가스의 열을 이용하여 연료를 개질 및 예열하는 동시에 공기도 예열할 수 있어 에너지 낭비를 방지할 수 있고, 상기 연료전지 스택부를 냉각하여 열적인 스트레스로부터 상기 스택부의 내구성을 증가시켜 전체 시스템 수명을 증가시킬 수 있으며, 상기 복수의 스택부는 상기 중앙챔버부를 공유하여 연료전지 핫박스의 구성을 간소화 할 수 있다. 또한, 개질기에 개폐장치를 구비하여 고온의 연소가스를 적절히 분배하여 연료전지의 운전 상태에 따라 연료의 개질률을 조절가능한 유연한 시스템을 구성할 수 있다.