본 발명은 메르스코로나바이러스를 식별 또는 검출하기 위한 바이오마커에 관한 것으로서, 보다 구체적으로 인간 감염이 가능한 메르스코로나바이러스를 식별 또는 검출하기 위한 바이오마커로 메르스코로나바이러스의 특정 단백질 변이체와 이 변이체를 코딩하는 유전자서열을 이용하는 기술에 관한 것이다. 본 발명에서 발굴한 메르스코로나바이러스의 ORF4b 단백질 변이체를 마커로 이용할 경우, 인체 감염이 용이한 메르스코로나바이러스를 식별 또는 검출할 수 있으며, 이를 통해 감염을 사전에 차단할 수 있다.