본 발명은 염기교정 유전자가위의 염기교정 효율 및 결과 예측 시스템, 및 상기 시스템을 이용하여 염기교정 유전자가위의 효율 및 결과를 예측하는 방법에 관한 것이다. 일 양상에 따른 예측 시스템을 사용하면, 유전자가위를 일일이 제작하여 검증할 필요 없이 간단한 방법으로 효율 및 정확성의 예측이 가능하여 안전한 교정이 가능한 유전자가위를 선별할 수 있다. 나아가, 병원성/유사병원성 인간 점돌연변이 질환 중 염기교정 유전자가위로 질환을 만들거나 교정할 수 있는 경우들의 효율 및 결과 빈도의 예측이 가능하여 염기교정 유전자가위의 대상 질환을 선별할 수 있다.