본 발명은 미생물 에어로졸화 과정 중 발생하는 손상 방지 방법에 관한 것으로, 아스코르브산(Ascorbic acid, AA) 및 소혈청알부민(Bovine serum albumin, BSA)으로 이루어진 군으로부터 선택된 1종 이상이 함유된 인산완충생리식염수(Phosphate buffered saline, PBS)용액이 들어있는 아토마이저(atomizer)에 미생물이 주입되는 제 1단계; 압축공기를 아토마이저(atomizer)로 주입시켜 바이오에어로졸을 분사하는 제 2단계;를 포함하는 미생물 에어로졸화 과정 중 발생하는 손상 방지 방법을 제공한다.