본 발명은 푸리에 타이초그래픽 기반 광학 이미징 시스템 및 그 방법에 관한 것으로서, 더욱 상세하게는, UV 영역을 포함하는 빛을 조사하는 광원부(100), 상기 광원부(100)에 의해 조사되는 빛을 소정 패턴으로 산란시키는 광 산란부(200), 이미징 측정하고자 하는 시편을 포함하고, 상기 시편에 상기 광 산란부(200)에 의해 소정 패턴으로 산란된 빛이 조사되는 시편부(300) 및 상기 시편을 투과한 이미지 신호를 획득하는 이미지 센서부(400)를 포함하는 푸리에 타이초그래픽 기반 광학 이미징 시스템에 관한 것이다.